軟件與生物之基因芯片

　　1、基因芯片綜合分析軟件。

　　ArrayVision7.0一種功能強大的商業(yè)版基因芯片分析軟件，不僅可以進行圖像分析，還可以進行數(shù)據(jù)處理，方便protocol的管理功能強大，商業(yè)版正式版：6900美元。

　　Arraypro4.0MediaCybernetics公司的產(chǎn)品，該公司的gelpro,imagepro一直以精確成為同類產(chǎn)品中的佼佼者，相信arraypro也不會差。

　　phoretix?ArrayNonlinearDynamics公司的基因片綜合分析軟件。

　　J-express挪威Bergen大學(xué)編寫，是一個用JAVA語言寫的應(yīng)用程序，界面清晰漂亮，用來分析微矩陣（microarray）實驗獲得的基因表達數(shù)據(jù)，需要下載安裝JAVA運行環(huán)境JRE1.2后(5.1M)后，才能運行。

　　2、基因芯片閱讀圖像分析軟件。

　　ScanAlyze2.44，斯坦福的基因芯片基因芯片閱讀軟件，進行微矩陣熒光圖像分析，包括半自動定義格柵與像素點分析。輸出為分隔的文本格式，可很容易地轉(zhuǎn)化為任何數(shù)據(jù)庫。

　　3、基因芯片數(shù)據(jù)分析軟件。

　　Cluster斯坦福的對大量微矩陣數(shù)據(jù)組進行各種簇（Cluster）分析與其它各種處理的軟件。SAMSignificanceAnalysisofMicroarrays的縮寫，微矩陣顯著性分析軟件，EXCEL軟件的插件，由Stanford大學(xué)編制。

　　4．基因芯片聚類圖形顯示。

　　TreeVieiga2.0的換代產(chǎn)品，accelrys公司Discoverystudio系列，accelrys公司的insightII,GCG是業(yè)內(nèi)蛋白分析和核酸分析的權(quán)威軟件，DSgene是GCG的個人機簡版，功能強大，而且可以直接與GCG服務(wù)器相連。由于受到vectorNTI的界面影響，DSgene與Omiga2.0相比界面有了很大的改變。

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